Tháng 10/1975, Ty Bảo đảm hàng hải được thành lập với nhiệm vụ bảo đảm an toàn giao thông hàng hải khu vực phía Nam. Đội Khảo sát ra đời thực hiện nhiệm vụ khảo sát lập bình đồ các tuyến luồng hàng hải thuộc phạm vi Ty Bảo đảm hàng hải quản lý. Trải qua nhiều thời kỳ, cùng với sự phát triển về quy mô, năng lực sản xuất của đơn vị chủ quản, từ Ty Bảo đảm hàng hải đến Tổng công ty Bảo đảm an toàn hàng hải miền Nam ngày nay, Đội khảo sát ngày càng phát triển và trở thành Xí nghiệp Khảo sát hàng hải miền Nam hiện nay với 80 CBCNV có trình độ chuyên môn vững vàng, năng động và sáng tạo trong công việc, luôn sẵn sàng hoàn thành xuất sắc mọi nhiệm vụ được giao.
Xí nghiệp Khảo sát hàng hải miền Nam là một trong những đơn vị hàng đầu ở Việt Nam trong lĩnh vực khảo sát hàng hải với hơn 40 năm kinh nghiệm, Xí nghiệp đã thực hiện nhiều loại công trình như: Khảo sát lập bình đồ độ sâu phục vụ công bố thông báo hàng hải các tuyến luồng hàng hải công cộng; vùng đón trả hoa tiêu; vùng nước trước cầu cảng, khu neo đậu tàu, khu chuyển tải; khảo sát địa hình phục vụ thiết kế thi công cảng, nạo vét luồng; rà tìm chướng ngại vật dưới đáy sông, biển (tàu đắm, bãi cạn, đá ngầm…) định vị, bố trí các báo hiệu hàng hải: phao báo hiệu, đèn biển...
Bộ máy quản lý, sản xuất của Xí nghiệp được tổ chức sắp xếp khoa học nên hoạt động sản xuất kinh doanh đạt hiệu quả cao, luôn hoàn thành kế hoạch đề ra. Nhiệm vụ khảo sát phục vụ thông báo hàng hải đảm bảo kịp thời, chính xác không để xảy ra sự cố hàng hải nào do công tác khảo sát gây ra. Tất cả các Tổ khảo sát của Xí nghiệp thường trực 24/24 giờ, đảm bảo giao thông thông suốt giúp cho các phương tiện thủy hành hải an toàn.
Xí nghiệp được trang bị những máy móchiện đại. Năm 1994, Xí nghiệp là một trong những đơn vị khảo sát đầu tiên trong cả nước được trang bị và ứng dụng hệ thống định vị vệ tinh DGPS vào công tác khảo sát. Hiện nay, Xí nghiệp đang sở hữu những trang thiết bị hiện đại nhất như hệ thống máy đo sâu đa chùm tia (Multibeam), máy rà tìm chướng ngại vật (Side scan sonar) ... sẵn sàng đáp ứng mọi yêu cầu về đo đạc, khảo sát hàng hải.
Ngoài việc thực hiện công tác khảo sát phục vụ công bố thông báo hàng hải 25 tuyến luồng hàng hải công cộng do Tổng công ty Bảo đảm an toàn hàng hải miền Nam quản lý, Xí nghiệp còn tham gia và hoàn thành xuất sắc những công trình trọng điểm quốc gia mang tính chiến lược phát triển kinh tế của đất nước đáng kể trong 10 năm gần đây, điển hình như:
- Đo đạc thủy địa hình sông Mekong, Sông Bassac và sông Vàm Nao;
- Khảo sát độ sâu cảng Quốc tế Cái Mép – Thị Vải năm 2009 và 2010;
- Rà quét phục vụ thanh thải container bị chìm trên luồng Vũng Tàu - Thị Vải năm 2012;
- Khảo sát dự án nạo vét luồng Soài Rạp (giai đoạn 2) thực hiện năm 2014;
- Khảo sát cảng nhà máy nhiệt điện Duyên Hải từ năm 2014 đến năm 2018;
- Khảo sát cảng nhà máy nhiệt điện Vĩnh Tân từ năm 2014 đến năm 2018;
Khảo sát rà tìm chướng ngại vật khu neo chờ đầu luồng Quan Chánh Bố năm 2017;
…
